Documentos históricos mostram que a cidade de Palhano entra para a história do Ceará na primeira metade do século XVIII, quando em 24 de outubro de 1733 foi feita a doação de uma Sesmaria de três léguas de terra (Datas e Fatos para História do Ceará, página 188) ao Coronel Manuel Gonçalves de Souza e ao Tenente-Coronel Estêvão de Souza Palhano, à margem do Riacho da Cruz, por serem descobridores do mesmo. A sesmaria denominada Cruz do Palhano, do Tenente-Coronel Estêvão de Souza Palhano, foi o primeiro povoado registrado na história do Ceará, na região onde hoje localiza-se o município de Palhano.

Na segunda metade do século XIX, em 18 de Agosto de 1882 um Ato provincial transforma a sesmaria do Sr. Estêvão em distrito, com a denominação de Cruz do Palhano subordinado ao município de São Bernardo de Russas. Pela lei provincial nº 2155, de 12 de agosto de 1889, transfere-se o distrito para município de União; E pelo decreto nº 58, de 4 de setembro de 1890, o distrito de Cruz do Palhano volta a pertencer ao município de São Bernardo das Russas.

Em divisão administrativa referente ao ano de 1911, 31 de dezembro de 1936 e 31 de dezembro de 1937, o distrito de Cruz de Palhano, figura no município de São Bernardo das Russas. E Pelo decreto nº 448, de 20 de dezembro de 1938, o distrito de Cruz de Palhano passou a denominar-se Palhano e o município de São Bernardo das Russas a denominar-se simplesmente Russas. Em divisão territorial datada de 1 de julho de 1950, o distrito de Palhano, figura no município de Russas. Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1 de julho de 1955.

O distrito de Palhano foi elevado à categoria de município com a denominação de Palhano, pela lei estadual nº 4076, de 8 de maio de 1958, desmembrando-se de Russas. A prefeitura foi instalada no dia 15 de maio de 1958, sendo designado para responder pela municipalidade João Luiz de Santiago, que permaneceu nas funções até 12 de abril de 1959, quando foi nomeado prefeito interino Miguel Correia de Oliveira, até que fossem realizadas eleições municipais.

O município de Palhano conta com 10 escolas de Ensino Fundamental e 1 escola de Ensino Médio. A rede municipal de ensino conta com aproximadamente 400 alunos na educação infantil, 1.300 alunos no ensino fundamental e 160 alunos na Educação de Jovens e Adultos:

EEF. Mateus Sobrinho (SEDE)
EEF. Padre Severino Xavier (SEDE)
EEF. Joselita Santiago do Amaral (Canto da Cruz)
EEF. Josefa Maria da Natividade (Lagoa da Telha)
EEF. Adelino da Silva (Almas)
EEF. José Nunes Sobrinho (Barbada)
EEF. Mateus Sobrinho (Jurema)
EEF. Francisco Silvestre de Oliveira (Cajueiro)
EEF. Francisco Domingos da Silva (Feijão Bravo)
EEF. Raimundo Nogueira Barros (Distrito São José)
EEM. José Francisco de Moura (SEDE)

O município é constituído de dois distritos:

Palhano (sede)
São José

Limites Geográficos de Palhano:

Ao Norte faz limite com Beberibe.
A Nordeste com a cidade de Aracati.
A Leste, com Itaicaba.
A Sudeste com a cidade de Jaguaruana.
Ao Sul, Oeste e Noroeste com a cidade de Russas.

O município possui como maior comunidade à comunidade de córrego da salça e vários aglomerados rurais. Sendo comumente dividido em duas grandes áreas: as comunidades da ribeira e as das lagoas. As comunidades da Ribeira são assim chamadas por estarem localizadas às margens do Rio Palhano. Já, as lagoas são comunidades estruturadas em torno de lagoas que existem no município. As principais comunidades da ribeira são Canto da Cruz, Alto São Luís, Lagoa da Telha, Lagoa Cercada, Almas. As principais comunidades das lagoas são Lagoa da Barbada, Cajueiro, Jurema, Pedra Branca, Feijão Bravo, Cedro Santana.